Родился 15. 11. 1930 г. в Алтайском крае. После службы в армии, закончил (1959 г.) естественно-географический факультет Горно-Атлайского госпединститута (ныне госуниверситет) по специальности биология, география, химия.
Научная деятельность М. А. Мальгина постоянно связана с Сибирским отделением АН СССР (РАН), где он прошел путь от старшего лаборанта до директора Новосибирского филиала Института водных и экологических проблем. В настоящее время – главный научный сотрудник этого Института.
Научные интересы Михаила Александровича связаны в основном с исследованием биогеохимии почв Алтае-Саянской горной области, сложнейшей в природном отношении. Кроме того, здесь находятся многочисленные рудные и нерудные месторождения и ореолы их рассеяния, осуществляется добыча, транспортировка и переработка минерального сырья, что ведет к загрязнению окружающей среды и, в первую очередь, почв. Алтае-Саянская горная страна много лет загрязнялась продуктами радиоактивного распада в связи с испытаниями ядерных устройств на Семипалатинском полигоне и на полигоне Лобнор (Китай). Следы былого загрязнения сохранились до сих пор, что показано в работах М. А. Мальгина и его коллег.
В почвах и других объектах окружающей среды, на этой территории, М. А. Мальгиным обнаружен дефицит йода, селена, фтора, фосфора и связанные с ним эндемические заболевания.
Итогом выполненных Михаилом Александровичем исследований является защищенная им в 1966 г. кандидатская диссертация «Биогеохимия и агрохимия марганца в Горном Алтае», а в 1997 г. – докторская диссертация «Биогеохимические особенности бассейна Верхней Оби» и около 200 публикаций (монографии, статьи в журналах и сборниках трудов).
Михаил Александрович занимается и педагогической деятельностью: под его руководством защищено 5 кандидатских и докторская диссертация.
М. А. Мальгин награжден медалью «За доблестный труд. В ознаменование 100-летия со дня рождения В. И. Ленина», Почетными грамотами Президиума Академии наук и Президиума Сибирского отделения АН.
С 1972 года лаборатория биогеохимии и агрохимии микроэлементов приобрела свой Горно-Алтайский филиал в с. Майма близ города Горно-Алтайска, возглавляемый биогеохимиком - к.б.н. М.А. Мальгиным. Он проработал в ИПА СО АН СССР до создания в 1987 году ИВЭП СО АН СССР и лаборатории биогеохимии в нем. Ныне ИВЭП СО РАН, возглавляет ученик д.б.н. М.А. Мальгина - д.б.н., профессор Пузанов А.В.
В изданных в 1977 году «Этюдах…» сотрудники лаборатории обрисовали картину распределения B, Со, Cu, Mo, Zn в почвенном покрове Западносибирской равнины и Горного Алтая, впервые представили схему биогеохимического районирования по поступлению B, Cu, Mo, Zn в пищевую цепь территории юга Западной Сибири, дали характеристику выделенной здесь области борного засоления, показали эффективность применения микроудобрений, содержащих Mn, Co, Cu, S на величину урожая сельскохозяйственных культур и его качество на разных почвах региона.
Работы М.А. Мальгина стали основой изучения с биогеохимических, почвенно-агрохимических и экологических позиций микроэлементов в горных породах и почвах, растениях и водах не только Горного Алтая, но и Алтайско-Саянской горной страны в целом, а также рекомендаций по устранению йодной недостаточности на Алтае.
С 1978 года многочисленная, в то время, лаборатория биогеохимии и агрохимии микроэлементов расширила географию исследований за пределы юга Западной Сибири и Горного Алтая до Забайкалья, Якутии, БАМа, Тувы. Активно изучалось содержание и поведение в почвах, растениях и водах не только микроэлементов (Fe. Mn. Zn, Cu, Co, B, S, I), но и тяжелых металлов (Pb, Cd), проводись опыты по оптимизации минерального питания растений на мелиорированных землях, действию тяжелых металлов разные виды растений.
